Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty ad

Osoby z rakiem gruczołu krokowego zostały zidentyfikowane i zrekrutowane z czterech z sześciu regionalnych rejestrów nowotworów w Szwecji. Kryterium włączenia do badania przypadków było potwierdzone biopsją lub potwierdzone cytologicznie gruczolakoraka prostaty, zdiagnozowane między lipcem 2001 a październikiem 2003. Spośród 3648 zidentyfikowanych osób z rakiem prostaty, 3161 (87%) zgodziło się wziąć udział. Próbki DNA z krwi, stadium przerzutów do węzłów chłonnych (TNM), stopnia Gleasona (jak określono za pomocą biopsji) oraz poziomu antygenu specyficznego dla prostaty (PSA) w momencie rozpoznania były dostępne dla 2893 osób (92%). Osoby z przypadkami zostały sklasyfikowane jako osoby z zaawansowaną chorobą, jeśli spełniły którekolwiek z poniższych kryteriów: nowotwór 3. lub 4. stopnia, rozprzestrzeniony na pobliskie węzły chłonne i przerzuty, wynik Gleasona równy 8 lub więcej lub poziom PSA większy niż 50 ng na mililitr; w przeciwnym razie, badani byli klasyfikowani jako posiadający zlokalizowaną chorobę. Osoby kontrolne, które rekrutowano równolegle z pacjentami z przypadkami, były losowo wybierane ze szwedzkiego rejestru populacji i dopasowywane zgodnie z oczekiwanym rozkładem wieku przypadków (grupy 5-letnich interwałów) i regionu geograficznego. Łącznie 2149 spośród 3153 osób kontrolnych (68%), którzy zostali zaproszeni, zgodziło się następnie wziąć udział w badaniu. Próbki DNA z krwi były dostępne dla 1781 osób kontrolnych (83%). Poziom PSA w surowicy był mierzony dla wszystkich osób kontrolnych, ale nie był stosowany jako zmienna wykluczająca. Historia raka gruczołu krokowego wśród krewnych pierwszego stopnia została uzyskana z kwestionariusza zarówno dla pacjentów indywidualnych, jak i osób z grupy kontrolnej.
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka kliniczna i demograficzna badanych. Tabela przedstawia cechy demograficzne i kliniczne badanych osób. Rekrutację badanej populacji przeprowadzono w dwóch fazach, z których każda miała podobną liczbę przedmiotów; pierwsza faza (CAPS-1) zakończyła się 31 października 2002 r., a druga faza (CAPS-2) zakończyła się listopada 2002 r. Każdy z uczestników wyraził pisemną świadomą zgodę. Badanie uzyskało aprobatę instytucjonalną od Karolinska Institutet, Uniwersytetu w Ume. i School of Medicine w Wake Forest University.
Wybór SNP do genotypowania
Wybraliśmy 16 SNP z pięciu regionów chromosomalnych (trzy w 8q24 i po jednym w 17q12 i 17q24.3), o których doniesiono, że są związane z rakiem gruczołu krokowego.6-8, 10 Testy reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) i startery wydłużające dla tych SNP zaprojektowano za pomocą oprogramowania MassARRAY, wersja 3.0 (Sequenom). (Informacje o starterach są dostępne na stronie www.wfubmc.edu/genomics.) Reakcje PCR i wydłużania reakcji wykonywano zgodnie z instrukcjami producenta, a rozmiary produktów rozszerzających określano za pomocą spektrometrii masowej z użyciem systemu iPLEX (Sequenom). Podwójne próbki testowe i dwie próbki wody (kontrole negatywne pod względem PCR), których technik nie był świadomy, umieszczono w każdej 96-studzienkowej płytce. Szybkość zgodnych wyników między duplikatami próbek wyniosła ponad 99%.
Analiza statystyczna
Testy dla równowagi Hardy ego-Weinberga przeprowadzono dla każdego SNP oddzielnie wśród osobników przypadków i osobników kontrolnych przy użyciu dokładnego testu Fishera. Równowaga sprzężeń parami została przetestowana pod kątem SNP w każdym z pięciu regionów chromosomalnych u osobników kontrolnych za pomocą oprogramowania SAS / Genetics, wersja 9.0 (SAS Institute).
Różnice w częstości alleli pomiędzy osobnikami będącymi przypadkami i osobnikami kontrolnymi testowano dla każdego SNP z użyciem testu chi-kwadrat z stopniem swobody
[patrz też: stomatolog poznań, stomatologia Kraków, forum kulturystyczne ]

Powiązane tematy z artykułem: forum kulturystyczne stomatolog poznań stomatologia Kraków