Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty cd

Allelic odds ratio i 95% przedziały ufności oszacowano na podstawie modelu multiplikatywnego. W przypadku genotypów przeprowadzono serię testów przy założeniu addytywnego, dominującego lub recesywnego modelu genetycznego dla każdego z pięciu SNP z zastosowaniem bezwarunkowej regresji logistycznej z dostosowaniem do wieku i regionu geograficznego; model o największym prawdopodobieństwie został uznany za najlepiej dopasowany model genetyczny dla danego SNP. Testowaliśmy niezależny efekt każdego z pięciu wcześniej implikowanych regionów, włączając najbardziej znaczący SNP z każdego z pięciu regionów w modelu regresji logistycznej z wykorzystaniem procedury selekcji wstecznej. Multiplikacyjne interakcje badano dla każdej pary SNP, włączając zarówno główne efekty, jak i termin interakcji (produkt dwóch głównych efektów) w modelu logistyczno-regresyjnym. Zbadaliśmy skumulowany wpływ pięciu SNP na raka gruczołu krokowego, licząc liczbę genotypów związanych z rakiem prostaty (na podstawie najlepiej dopasowanego modelu genetycznego z analizy pojedynczego SNP) dla tych pięciu SNP u każdego osobnika. Czytaj dalej Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty cd

Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty ad

Osoby z rakiem gruczołu krokowego zostały zidentyfikowane i zrekrutowane z czterech z sześciu regionalnych rejestrów nowotworów w Szwecji. Kryterium włączenia do badania przypadków było potwierdzone biopsją lub potwierdzone cytologicznie gruczolakoraka prostaty, zdiagnozowane między lipcem 2001 a październikiem 2003. Spośród 3648 zidentyfikowanych osób z rakiem prostaty, 3161 (87%) zgodziło się wziąć udział. Próbki DNA z krwi, stadium przerzutów do węzłów chłonnych (TNM), stopnia Gleasona (jak określono za pomocą biopsji) oraz poziomu antygenu specyficznego dla prostaty (PSA) w momencie rozpoznania były dostępne dla 2893 osób (92%). Osoby z przypadkami zostały sklasyfikowane jako osoby z zaawansowaną chorobą, jeśli spełniły którekolwiek z poniższych kryteriów: nowotwór 3. Czytaj dalej Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty ad

Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty

Polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) w pięciu regionach chromosomalnych – trzy w 8q24 i po jednym w 17q12 i 17q24.3 – były związane z rakiem prostaty. Każdy SNP ma tylko umiarkowane powiązanie, ale gdy SNP są połączone, powiązanie może być silniejsze. Metody
Oceniliśmy 16 SNP z pięciu regionów chromosomowych w populacji szwedzkiej (2893 pacjentów z rakiem prostaty i 1781 osób kontrolnych) i oceniano indywidualne i skojarzone powiązanie SNP z rakiem prostaty.
Wyniki
Wiele SNP w każdym z pięciu regionów było związanych z rakiem prostaty w pojedynczej analizie SNP. Gdy wybrano najbardziej znaczący SNP z każdego z pięciu regionów i włączono do analizy wielu zmiennych, każdy SNP pozostał istotny po dostosowaniu do innych SNP i historii rodziny. Czytaj dalej Zbiorcze skojarzenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty